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迪安诊断参与中国丙型肝炎病毒基因型的分子流行病学及系统进化分析研究

近日,迪安诊断(300244)与重庆医科大学附属第二医院感染病科、重庆医科大学病毒性肝炎研究所、教育部感染性疾病分子生物学重点实验室胡鹏教授团队在杂志《Infectious Disease of Poverty 》(IF=8.1,中科院一区,TOP期刊)上以Original Article形式在线发表了关于中国大陆不同区域丙型肝炎病毒基因型的分子流行病学及系统发育分析的研究结果。

本研究是一项多中心的回顾性研究,共纳入了来自中国大陆的29个省、直辖市及自治区的丙型肝炎病毒(HCV)感染患者共11008例。针对纳入患者,本研究对HCV基因型在不同区域、不同省、市及自治区、不同人群中的分布进行分析研究,并在分子流行病学层面上对HCV的基因型分布及系统发育进化进行了分析。

研究结果


(相关资料图)

HCV作为病毒性肝炎主要感染病毒之一,共有包括基因1型、2型、3型和6型4种基因型在内的14个细分基因亚型。本研究表明,我国的HCV流行的型别中,基因1型比例最高,占比49.2%,其次是基因2型、3型和6型,分别占22.4%、16.4%和11.9%。按照基因亚型细分的话,排在前五位的基因亚型分别为1b、2a、3b、6a和3a。和既往报道的数据相比来看,基因1型和2型的比例有所下降,而基因3型和6型的比例则有所上升(P < 0.001)。

HCV基因亚型在全国的分布情况以及和之前的数据的比较。

本研究进一步表明:按照年龄、性别分层划分HCV分子流行病学来看,HCV基因3型和6型集中在30至50岁的患者中,且男性患者中1b和2a亚型的比例低于女性患者(P < 0.01)。而从区域分子流行病学来看,基因3型和6型在中国大陆的南部地区相对北部地区更为流行。

HCV基因亚型在中国不同区域及不同省/市/自治区的分布情况。

对基因型别测序结果进一步分析,结果发现HCV基因1b和2a亚型的全国性传播与中国大陆北部地区的序列相关,而3a、3b和6a亚型的全国性传播与中国大陆南部地区的序列有关,这预示着HCV不同基因型别可能的起源和发展变迁。

通过NS5B部分序列构建最大似然树。图a-e分别显示了HCV 1b、2a、3a、3b和6a亚型的系统发生分析结果。不同颜色代表不同的地理区域。华南地区:浅蓝色,西南地区:正红色,西北地区:紫色;华北地区:深蓝色,华东地区:绿色,东北地区:黄色,华中地区:粉红色。

总而言之,HCV基因亚型1b和2a仍然是中国大陆最常见的两个基因亚型,涵盖了我国70%左右的HCV感染,但其比例在过去几年中有所下降,而基因3型和6型的比例有所上升。另外值得关注的是,基因型别的流行具有比较典型的南北区域差异。

消除丙肝工作是《“健康中国2030”规划纲要》中的组成部分,本研究提供了中国大陆HCV病毒流行株的流行病学图谱,有助于HCV感染的预防、诊断和治疗,为中国消除丙肝工作提供参考。

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